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结构速递 | 一周“结构”要览 VOL.75(8.07~8.13)

谭佳鑫 北京生物结构前沿研究中心 2024-04-29

上周发布了哪些“结构”文章?又取得了哪些科研进展?


结构速递栏目以每周“结构”相关领域刊文为主题,梳理一周结构发文大事记,“结构速递”为您传递最新、最快、最权威的结构资讯。

2023.8.07~2023.8.13

CNS刊登文章

01

  Nature

2023/8/09

“Tail engagement of arrestin at the glucagon receptor”


G蛋白(G protein)和阻遏蛋白(arrestin)在GPCR的信号转导和功能调控中发挥不同的作用。其中,arrestin介导受体的脱敏和内化。以往研究发现,GPCR可能通过两种方式与arrestin结合:一种为受体的跨膜结构域的核心区域以及受体的C端共同与arrestin结合,被称为“core”构象;另外一种则由受体的C端区域单独与arrestin作用,被称为“tail”构象。这两种构象被认为参与介导受体信号转导和分子运输的不同过程,对受体的功能发挥不同调控作用。然而,之前发表的所有GPCR与arrestin的复合物结构均为“core”构象,“tail”构象的具体作用机制不明。


来自中国科学院上海药物研究所吴蓓丽课题组与赵强课题组解析了胰高血糖素受体(GCGR)在胰高血糖素结合和无配体状态下与β-抑制蛋白1 (βarr1)结合的两种结构。首次揭示了arrestin的全新“tail”结合模式。螺旋VIII代替了受体核心,通过与βarr1的中央形成广泛的相互作用,在调节βarr1中起主要作用。通过βarr1 C-edge与受体螺旋束之间的接近进一步定义了tail结合姿态,并通过连接βarr1与GCGR的螺旋I和VIII的磷酸肌苷衍生物来稳定tail结合姿态。由于缺乏与抑制素的任何接触,受体核心处于失活状态,松散地与胰高血糖素结合。进一步的功能研究表明,GCGR -βarr的尾部构象控制着GCGR在质膜上的βarr募集和内吞作用,为受体与G蛋白和βarr同时形成超复合物以促进内体内持续信号传导提供了分子基础。这些发现扩展了我们对抑制素介导的GPCR功能调节的认识。

原文链接


https://www.nature.com/articles/s41586-023-06420-x

02

 Cell 


2023/8/08

“Molecular mechanism for Tn7-like transposon recruitment by a type I-B CRISPR effector”


Tn7样转座子与CRISPR-Cas系统合作,促进了自身DNA的移动。这些CRISPR相关转座子(CAST)是可编程基因敲除的有望工具。CAST的一个主要特点是能够将Tn7样转座子招募到核酸酶缺陷的CRISPR效应器上。然而,人们对Tn7样转座子是如何被不同的CRISPR效应器招募的仍然知之甚少。


来自美国普渡大学Leifu Chang解析了来自Peltigera membranacea cyanobiont 210A的T的I-B型CAST的靶标DNA,Cascade复合物、TniQ、和TnsC组成的复合物的冷冻电镜结构。Cascade对靶标DNA的识别会诱导Cas6发生构象变化,并通过其C端结构域启动TniQ的招募。TniQ的N端结构域与TnsC螺旋七聚体的接缝区域结合。这项发现让人们深入了解了Tn7样转座子招募到CRISPR效应器的不同机制,并将有助于开发CAST作为基因敲除工具。

原文链接


https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(23)00743-2


2023.8.07~2023.8.13

子刊刊登文章


01

Molecular Cell 


8.07

 “G-quadruplexes associated with R-loops promote CTCF binding”

02

Nature Structural & Molecular Biology

8.07

1. “Structural conservation of antibiotic interaction with ribosomes”

8.07

2.“DELE1 oligomerization promotes integrated stress response activation”

8.07

3.“The structure of the NuA4–Tip60 complex reveals the mechanism and importance of long-range chromatin modification”


03

Nature Communications

8.08

1.“Structure of lasso peptide epimerase MslH reveals metal-dependent acid/base catalytic mechanism”

8.08

2.“Modulation of translational decoding by m6A modification of mRNA”

8.08

3.“Structure, catalysis, chitin transport, and selective inhibition of chitin synthase”

8.08

4. “Cryo-EM structures of Uba7 reveal the molecular basis for ISG15 activation and E1-E2 thioester transfer”

8.08

5.“Cryo-EM structures of human zinc transporter ZnT7 reveal the mechanism of Zn2+ uptake into the Golgi apparatus”

8.09

6. “Structural basis for a degenerate tRNA identity code and the evolution of bimodal specificity in human mitochondrial tRNA recognition”

8.09

7.“Catalytic site flexibility facilitates the substrate and catalytic promiscuity of Vibrio dual lipase/transferase”

8.09

8.“Structure and regulation of full-length human leucine-rich repeat kinase 1”

8.09

9. “Origin and arrangement of actin filaments for gliding motility in apicomplexan parasites revealed by cryo-electron tomography”

8.08

10. “Structure of lasso peptide epimerase MslH reveals metal-dependent acid/base catalytic mechanism”

8.10

11. “Mechanism of U6 snRNA oligouridylation by human TUT1”

8.10

12. “Structural basis of agonist specificity of α1A-adrenergic receptor”

8.10

13.“High resolution cryo-EM and crystallographic snapshots of the actinobacterial two-in-one 2-oxoglutarate dehydrogenase”

8.12

14. “Fluorescent protein lifetimes report densities and phases of nuclear condensates during embryonic stem-cell differentiation”

8.12

15. “Identification of a drug binding pocket in TMEM16F calcium-activated ion channel and lipid scramblase”

8.12

16.“Molecular mechanism underlying regulation of Arabidopsis CLCa transporter by nucleotides and phospholipids”


04

Science Advances

8.09

 “Structural basis of histone H2A lysine 119 deubiquitination by Polycomb repressive deubiquitinase BAP1/ASXL1”



Cell Research

本周无


作者 | 谭佳鑫

审稿 | 肖媛

责编 | 囡囡

设计、排版 | 可洲


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